Profesyonel hayatının 22 yılını Birleşmiş Milletler’in farklı kuruluşlarında geçirdi. Avrupa Birliği’nin bölgeler, genişleme, dış ilişkiler ve adalet içişleri politikaları üzerine, diğer tarafta azınlıklarla ilgili hafıza politikaları üzerine çalışıyor. BM görevi esnasında AB’nin adalet ve içişleri politikası bağlamında Orta Avrupalı aday ülkelerde kapasite inşası programlarını yönetti. BM görevi münasebetiyle bulunduğu ülkelerin üniversitelerinde dış politika, uluslararası kuruluşlar ve AB konularında seminerler verdi. 1999’dan bu yana Galatasaray ve Bahçeşehir Üniversitelerinde öğretim üyeliği yaptı. Halen İstanbul Politikalar Merkezi’nde kıdemli uzman. Hrant Dink Vakfı’ndaki görevine ilâveten Taraf ve Today’s Zaman’da köşe yazarlığı, Açık Radyo’da 1999’dan bu yana düzenli yorum yapıyor. Buğday, Fransız sosyal bilimler dergisi MAUSS danışmanı. Dokuz kitabı ve pek çok bilimsel makalesi yayımlandı. En son İletişim Yayınları’ndan Ekümenik Patrikhane derlemesi çıktı.