1755’te Almanya’nın Saksonya eyaletine bağlı Meissen’de doğdu. Erken yaşta İngilizce, Fransızca, İtalyanca, Yunanca ve Latince öğrendi. Leipzig Üniversitesi’nde başladığı tıp eğitimini Viyana ve Erlangen üniversitelerinde sürdürerek 1779’da tamamladı. Kısa süre doktorlu yaptıysa da, çok geçmeden mevcut tıp anlayışı ve uygulamalarıyla ilgili hoşnutsuzluğu nedeniyle mesleğini terk etti, bilim ve tıp kitapları çevirmeye başladı. Aynı dönemde ilaç denemeleri yapmaya ve “benzer benzeri iyileştirir” ilkesine dayalı bir şifa yöntemi olan homeopatiyi geliştirmeye başladı. 1791’de çalışmaları nedeniyle Leipzig Bilim Akademisi Ödülü’ne değer görüldü. 1810’da, Rasyonel İyileştirme Sanatı Organon’un ilk baskısı yayımlandı. Hahnemann homeopatinin temel ders kitabı kabul edilen bu eser üzerinde ölümüne kadar çalışmaya devam edecek ve her defasında yeni çalışma bulgularını ekleyerek toplam altı baskı hazırlayacaktı. 1811’de Leipzig Üniversitesi’nde homeopati dersleri vermeye başladı ve burada şifa yöntemini uygulayıp yayacak çok sayıda öğrenci yetiştirdi. 1829’da Köthen’de ilk homeopati derneğini kurdu. Hahnemann 1834’te Paris’e taşındı ve dünyanın farklı yerlerinden gelen öğrencilerine öğretisini aktarmaya devam etti. 1843’te soğuk algınlığı sonucunda hayatını kaybetti.
